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我和医疗数据科学的相爱相杀

(此处应有爆炸头表情包)

作为一个每天和数据较劲的伪码农,我最近被医疗数据科学狠狠上了一课——不是数学公式让我崩溃,而是那些藏在电子病历里的"玄学数据"。

数据整合现场
图1:当我试图把不同医院的数据整合成表格时...

上周处理某三甲医院的糖尿病患者数据,发现血糖值单位有的用mmol/L,有的用mg/dL。更绝的是某个字段叫"血压异常",但数值居然是"高血压7,糖尿病14"。我对着Excel抓耳挠腮三小时,突然意识到——这可能是人类历史上最抽象的二进制编码。

def clean_data(df):
    df['血压异常'] = df['血压异常'].replace({'高血压': 1, '糖尿病': 2})
    df['血糖值'] = df.apply(lambda row: row['血糖值']*18.018 if row['单位']=='mmol/L' else row['血糖值'], axis=1)
    return df.drop(columns=['单位'])

# Bug预警:这里漏掉了"正常"的编码,导致后续分析出现鬼知道什么结果

(突然插入冷笑话)你知道最恐怖的数据是什么吗?是那个标注为"患者年龄"的字段里居然有负数...后来才知道那是系统用补码表示的"保密年龄"。


当AI遇见病历

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图2:某AI辅助诊断系统的操作界面

上周在清华临床医学院蹭课时,老师演示了AI如何处理病历。有个病例特别有意思:患者主诉是"头晕",AI却坚持认为这是"脑震荡早期症状"。后来发现是医生手误把"眩晕症"写成了"悬晕症",AI硬生生把"悬"理解成了"悬挂"...

现在某三甲医院用的AI辅助系统,据说能识别400种疾病特征。但有个段子流传甚广:系统把CT报告里的"肺部阴影"和"天气预报"里的"多云"搞混了,导致某次会诊时医生集体沉默了十分钟——AI确实说对了当天的天气。


数据孤岛生存指南

(突然卡壳)等等...我是不是该查证一下这个"数据孤岛"的定义?(翻看笔记)哦对,就是不同机构间数据不能互通...就像我前天尝试整合三个医院的乳腺癌数据,结果发现:

  • 医院A用"CA-Breast"
  • 医院B写"乳癌"
  • 医院C直接画了个粉色心形

最后我只能在代码里写满if-else,感觉自己像个数据翻译官:

def standardize_diagnosis(diagnosis):
    mapping = {
        'CA-Breast': '乳腺癌',
        '乳癌': '乳腺癌',
        'Breast Cancer': '乳腺癌',
        '❤': '乳腺癌'  # 这个映射让我怀疑人生
    }
    return mapping.get(diagnosis, '未知疾病')

(突然插入冷笑话)你知道为什么医生和数据科学家总吵架吗?因为前者说"这个病人肯定有糖尿病",后者会说"你的置信区间呢?"


隐私保护的奇幻漂流

说到数据隐私,我经历过最离谱的事是:某医院要求我们签署保密协议,但他们的数据传输协议居然是明文传输!当我指出这个漏洞时,IT主任说:"反正都是内部网络,不怕。"然后三个月后他的电脑在咖啡厅被蹭网的黑客黑了...

现在流行用联邦学习解决这个问题,但实际操作起来比想象中难。上周调试代码时,我的模型在本地训练准确率95%,但联邦学习后掉到60%。调试一整天才发现——原来其他节点的数据都是十年前的!

from syft import hook, VirtualWorker

hook = hook(torch)
hook.local_worker._id = "central"

workers = [VirtualWorker(hook, id="hospital_{}".format(i)) for i in range(3)]

# Bug预警:忘记设置数据同步间隔,导致模型参数混乱

(突然卡壳)等等...我是不是把联邦学习和差分隐私搞混了?(快速查阅资料)不,联邦学习是数据不动模型动,差分隐私是加噪声...啊!我上周写的差分隐私代码其实没加噪声!


未来已来(可能还没来)

虽然现在医疗数据科学还处于"薛定谔的成熟期",但确实有一些惊艳的应用。比如鹰瞳科技的视网膜AI,据说能通过眼睛照片预测心血管疾病。我亲自测试了下,系统说我"压力指数偏高"——可能是因为我调试代码的时间太长?

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图3:某视网膜AI的诊断界面(可能正在判断你是不是熬夜选手)

还有那个能让医生工作效率翻倍的AI助手,据说能自动生成病历。不过我试用时发现个神奇现象:当患者主诉是"头疼"时,系统生成的病历会自动加上"建议多喝热水"——这大概率是训练数据里中医大夫太多了。


写在最后

医疗数据科学就像个刚学会走路的孩子,时而踉跄,时而惊喜。昨天刚听说某医院用AI预测术后感染率,准确率居然超过了资深护士长。但今天又爆出某AI诊断系统把黑色素瘤误判为痣的新闻...

不过正如我导师说的:"数据不会说谎,但解读数据的人会。"或许这就是为什么我们需要更多既懂医学又懂数学的"杂家"吧?

(突然插入冷笑话)你知道最完美的医疗数据系统是什么样的吗?是连"死亡"这个字段都能自动生成安慰邮件的那种...

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