构建水盒子

建立空的三维文件

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绘制一个水分子

在这里插入图片描述在空白面板点击一下,添加一个氧3,然后按Esc退出
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选择自动加氢
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构建完成
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以上步骤使用步骤大约是下面这样

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调用Amorphous Cell模块进行计算

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计算设置
设置基于哪个文件构建多少个分子,以及设置水盒子的大小
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水盒子的a,b需要与固体表面的相同
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设置好后进行计算,注意要用个人电脑进行计算,在服务器上不可以
在这里插入图片描述计算成功
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给固体表面构建一个与水盒子一样大的真空层

复制水盒子到固体表面

先给固体构建一个高度与水分子盒子相同高度的真空层,然后将水盒子复制进来
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适当调整

将太近的水分子挪一下或者删除
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在这里插入图片描述这样构建的是一个亲水界面
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