出现该情况说明默认下载目标不适配于当前使用的R版本，需要手动下载，步骤如下。

1.确认包到底在哪个源  

- CRAN 包：在浏览器打开  

  https://cran.r-project.org/package=xxx  

  如果能看到 DESCRIPTION 信息，就是 CRAN 的。  

- Bioconductor 包：在  

  https://bioconductor.org/packages/xxx  

  能查到，就是 Bioconductor 的。  （下载了符合R版本的Bioconductor，Bioconductor一般会自动匹配与自己版本对应的适用包）

- GitHub/R-forge 等：上面两处都没有，多半是 GitHub 等托管。

2. 从源安装  

包安装信息表

包的归属	安装命令	常见注意点
CRAN	`install.packages("xxx")`	换镜像、指定 `repos`；若包已归档，用源码或旧版。
Bioconductor	`BiocManager::install("xxx")`	先 `install.packages("BiocManager")`；版本不匹配时加 `version = "3.xx"` 。
GitHub	`remotes::install_github("作者/仓库")`	需预先 `install.packages("remotes")`；Windows 需 Rtools。

Github&bioconductor下载R包详细方法

3. 版本不匹配时的 4 个补救办法  

1. 升级/降级 R  

   官方建议用最新版 R，但生信环境常锁定旧版；可在同一台机器用 `rig`/`r-switch`/`conda` 并存多个 R。  

2. 指定 Bioconductor 版本  

   ```

   if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))

       install.packages("BiocManager")

   BiocManager::install(version = "3.21")   # 与当前 R 匹配

   BiocManager::install("xxx")

   ```  

   系统会提示你该用哪个 `version` 。  

3. 安装旧版 CRAN 包  

  

 ```

   # 方式 A：archive 页面手动下载

   install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/xxx/xxx_1.2.3.tar.gz",

                    repos = NULL, type = "source")



   # 方式 B：remotes 一键

   remotes::install_version("xxx", version = "1.2.3")

   ```

4. 源码或二进制本地安装  

   Windows 下载 `.zip`，Linux/macOS 下载 `.tar.gz`，然后   

  ```

   install.packages("xxx.zip", repos = NULL, type = "win.binary")  # Windows

   R CMD INSTALL xxx.tar.gz                             # Linux/macOS

   ```

报错“not available”处理流程表

步骤	操作	情况判断	处理方式
1	拼写/大小写检查	大小写错误	修正
2	查 CRAN 页面	存在	换镜像/源码安装
2	查 CRAN 页面	不存在	继续到3
3	查 Bioconductor 页面	存在	BiocManager::install()
3	查 Bioconductor 页面	不存在	继续到4
4	GitHub搜索	存在	remotes::install_github("作者/xxx")

R报错笔记