机器学习-PCA降维、去噪(4.2)
目录一.高维数据向低维数据映射二.实现自己封装的PCA三.scikit-learn中的PCA四.降噪手写识别的例子一.高维数据向低维数据映射m个样本,映射到k维主成分分析得到前k个方向的矩阵Wk,W第一行是最重要的,第二行是次重要,以此类推。高维向低维映射低维数据恢复到高维寻找一个坐标表示原来的样本,即主成分。找出前k个主成分,就可以将所有的样本映射...
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目录
一.高维数据向低维数据映射
m个样本,映射到k维
主成分分析得到前k个方向的矩阵Wk,W第一行是最重要的,第二行是次重要,以此类推。
- 高维向低维映射

- 低维数据恢复到高维

寻找一个坐标表示原来的样本,即主成分。找出前k个主成分,就可以将所有的样本映射到这k个轴上。
二.实现自己封装的PCA
PCA类:
先把w存到components_中去,其次是利用上面的计算公式,完成transform(高维向低维映射)
以及inverse_transform(低维向高维)
import numpy as np
class PCA:
def __init__(self, n_components):
"""初始化PCA"""
assert n_components >= 1, "n_components must be valid"
self.n_components = n_components
self.components_ = None
def fit(self, X, eta=0.01, n_iters=1e4):
"""获得数据集X的前n个主成分"""
assert self.n_components <= X.shape[1], \
"n_components must not be greater than the feature number of X"
def demean(X):
return X - np.mean(X, axis=0)
def f(w, X):
return np.sum((X.dot(w) ** 2)) / len(X)
def df(w, X):
return X.T.dot(X.dot(w)) * 2. / len(X)
def direction(w):
return w / np.linalg.norm(w)
def first_component(X, initial_w, eta=0.01, n_iters=1e4, epsilon=1e-8):
w = direction(initial_w)
cur_iter = 0
while cur_iter < n_iters:
gradient = df(w, X)
last_w = w
w = w + eta * gradient
w = direction(w)
if (abs(f(w, X) - f(last_w, X)) < epsilon):
break
cur_iter += 1
return w
X_pca = demean(X)
self.components_ = np.empty(shape=(self.n_components, X.shape[1]))
for i in range(self.n_components):
initial_w = np.random.random(X_pca.shape[1])
w = first_component(X_pca, initial_w, eta, n_iters)
self.components_[i,:] = w
X_pca = X_pca - X_pca.dot(w).reshape(-1, 1) * w
return self
def transform(self, X):
"""将给定的X,映射到各个主成分分量中"""
assert X.shape[1] == self.components_.shape[1]
return X.dot(self.components_.T)
def inverse_transform(self, X):
"""将给定的X,反向映射回原来的特征空间"""
assert X.shape[1] == self.components_.shape[0]
return X.dot(self.components_)
def __repr__(self):
return "PCA(n_components=%d)" % self.n_components
jupter中实现示例


三.scikit-learn中的PCA
使用真实数据

先使用对原始数据做一下分类,这里我们应用KNN算法

再对数据降维,用KNN分类

通过观察,如果选取降维的维数成为需要探索的问题。
pca.explained_variance_ratio_可查看成分依次可以解释的方差是多少

使用PCA对数据进行降维可视化,可以看出来,二维空间特征挺明显,降到二维有明显区分度。

四.降噪
降维的过程可以理解成是去噪。
手写识别的例子
去噪之前

使用pca去噪,保留成分解释的50%

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