MtAA-NET【放射剂量预测】
MtAA-Net,本文于2022年发表于中科院1区期刊 Knowledge-based Systems
Explainable attention guided adversarial deep network for 3D radiotherapy dose distribution prediction【放射剂量预测】
原文地址
本文于2022年发表于中科院1区期刊 Knowledge-based Systems
MtAA-NET
背景
现有方法可简单分为知识规划(KBP)方法和深度学习(DL)方法
KBP
简单来说就是以之前病人的治疗计划为参考,来为对现在的病人进行剂量分布预测,以制定新的治疗计划。
但它们依赖耗时且精度低的手工特征(Dose-volume histogram (DVH) , Overlap volume histogram (OVH), Distance-to-target histograms (DTH) 等);这些手工特征大多是一二维的统计数据,缺乏剂量分布的空间信息,且没考虑肿瘤解刨结构和位置信息,忽略了对周围脏器的影响。
DL
大多数方法除CT图像外,还需要额外的解刨特征图。
而且,在临床上,要求计划靶体积PTV上的剂量达到一定标准,而危险器官OAR上的剂量尽可能少。这说明在以往方法中两个独立的任务 分割(segmentation) 和 剂量分布预测(dose distribution prediction) 之间是存在一定联系的。
主要思路
仅采用CT图像作为输入(不需要物理师的专业知识),通过多任务学习,在利用辅助分割任务得到PTV和OAR的分割图的同时,通过剂量预测任务得到它们的剂量图。
模型设计

Shared Encoder
共享编码器,利用多任务学习思想,通过共享隐藏层硬参数,提取两个任务高度相关的信息,从而降低过拟合风险。
具体来说,CT图经卷积网络提取关键特征,得到降维后的数据。该数据随后被输入到两个任务(辅助分割和剂量预测任务,均为encoder-decoder结构)的共享编码器中。
Segmentation Decoder
分割解码器,采用传统U-Net结构,以及Skip connection对信息进行传播,缓解梯度消失问题。
最终,可得到PTV和OAR的分割掩码(图中Segmentation)。
Dose Decoder
为提高剂量预测精度,作者在剂量解码器部分设计了两个增强策略:Cross-task feature fusion (CtFF) moudule 和 Deep supervision (DS) mechanism。
CtFF

简单来说, CtFF模块
①首先,将来自分割和剂量解码器一层的特征连接,经过两层卷积后,可以得到单通道权重图,然后再次与剂量解码器特征相乘。可以发现,(上图中黑红色的图)的PTV的区域被强调了,这个步骤的目的也在于此。
②随后,将来自共享编码器的特征与上个步骤得到的特征串联,经卷积层后,输入下一层剂量解码器。
DS
这个深度监督策略,即在每一个CtFF模块后,将这个模块得到的特征图激活得到中间图像,然后利用绝对误差损失鼓励其与真实值保持相似,可加速网络收敛。这个损失在文中定义为:
y i y_i yi为ground truth下采样得到, y i p y_i^p yip即为中间图像, n n n为CtFF的模块数。
AdvNet
Shared encoder和Dos decoder一起是一个生成器,而AdvNet实际上是一个鉴别器
GAN,其原理主要基于生成器和鉴别器的相互对抗博弈,通过这种对抗过程最终产生较好的输出。在这个博弈中,生成器的目标是生成尽可能接近真实数据分布的假数据,使得判别器难以区分;而判别器的目标则是尽可能准确地判断输入数据的真实性。两者在博弈中不断提升自己的能力。
AdvNet以①一对预测剂量分布图与CT图像和②一对实际剂量分布图与CT图像作为输入,试图区分它们的真假。
也就是说,在这里AdvNet是为了增强剂量预测任务的准确性而设计的,只在模型训练环节中使用。
实验结果
评价指标
评价指标 C I CI CI, H I HI HI, D V H DVH DVH, D i c e Dice Dice, M e a n Mean Mean,分别用于评价预测,分割,和量化真实值与预测结果的差异。
其中 T V TV TV为靶体积, P I V PIV PIV为处方等剂量体积, T V P I V TV_{PIV} TVPIV为靶体积与处方等剂量体积的交集。地面真值与预测图的相似度越高,表明预测模型的性能越好。
D x D_x Dx是覆盖PTV体积 x x x%的吸收剂量,HI越小,预测结果越好。
剂量-体积直方图(DVH),在DVH图中,横坐标表示吸收剂量值,纵坐标表示暴露于相应剂量的体积百分比。
Conformity index (CI) 和 Heterogeneity index (HI), Dose-volume histogram (DVH)共同用于评估模型预测性能。
A是预测图像,B是真实情况。 D i c e Dice Dice的取值范围是0 ~ 1,越好越接近1。
D i c e Dice Dice用于评估分割任务性能。
为了量化真实值与预测结果之间的差异,本文用Mean±SD表示预测误差△,其中SD为标准差。
预测
私有宫颈癌数据结果如Table 4所示
OpenKBP-2020 AAPM Grand Challenge头颈癌数据结果如Table 5所示
总体来说, MtAA-NET的性能相对最好,且计算效率较高。
分割


辅助分割任务结果在临床上也是可以接受的。
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